Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VPREB3Q9UKI3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VPREB3Q9UKI3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VPREB3Q9UKI3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms