Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LSM7Q9UK45 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LSM7Q9UK45 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM7Q9UK45 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM7Q9UK45 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM7Q9UK45 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM7Q9UK45 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM7Q9UK45 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LSM7Q9UK45 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSM7Q9UK45 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSM7Q9UK45 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LSM7Q9UK45 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LSM7Q9UK45 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSM7Q9UK45 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms