Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HDAC6Q9UBN7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC6Q9UBN7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HDAC6Q9UBN7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDAC6Q9UBN7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms