Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNRD1Q9P1U0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRD1Q9P1U0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRD1Q9P1U0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms