Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ08

ERAP1, Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERAP1Q9NZ08 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ERAP1Q9NZ08 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERAP1Q9NZ08 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERAP1Q9NZ08 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERAP1Q9NZ08 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERAP1Q9NZ08 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERAP1Q9NZ08 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERAP1Q9NZ08 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERAP1Q9NZ08 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERAP1Q9NZ08 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERAP1Q9NZ08 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ERAP1Q9NZ08 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ERAP1Q9NZ08 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ERAP1Q9NZ08 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ERAP1Q9NZ08 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERAP1Q9NZ08 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERAP1Q9NZ08 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms