Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM9Q9NQV7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM9Q9NQV7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM9Q9NQV7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM9Q9NQV7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM9Q9NQV7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms