Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP31

SH2D2A, SH2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D2AQ9NP31 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH2D2AQ9NP31 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2D2AQ9NP31 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH2D2AQ9NP31 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH2D2AQ9NP31 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms