Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80BQ9C086 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80BQ9C086 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
INO80BQ9C086 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
INO80BQ9C086 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.57■■■□□ 2
INO80BQ9C086 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms