Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BBS2Q9BXC9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BBS2Q9BXC9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBS2Q9BXC9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS2Q9BXC9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms