Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTKNQ9BST9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTKNQ9BST9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RTKNQ9BST9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTKNQ9BST9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTKNQ9BST9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms