Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PYM1Q9BRP8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PYM1Q9BRP8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PYM1Q9BRP8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PYM1Q9BRP8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms