Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPAS2Q99743 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPAS2Q99743 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPAS2Q99743 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPAS2Q99743 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.5 ms