Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGLYRP2Q96PD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGLYRP2Q96PD5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PGLYRP2Q96PD5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PGLYRP2Q96PD5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGLYRP2Q96PD5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms