Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3KBP1Q96B97 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3KBP1Q96B97 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3KBP1Q96B97 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3KBP1Q96B97 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms