Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX9

MIB2, E3 ubiquitin-protein ligase MIB2, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2Q96AX9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MIB2Q96AX9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIB2Q96AX9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIB2Q96AX9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIB2Q96AX9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIB2Q96AX9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms