Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TSR2Q969E8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TSR2Q969E8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TSR2Q969E8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TSR2Q969E8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TSR2Q969E8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
TSR2Q969E8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TSR2Q969E8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TSR2Q969E8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TSR2Q969E8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TSR2Q969E8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
TSR2Q969E8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TSR2Q969E8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms