Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX29Q8TEQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNX29Q8TEQ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX29Q8TEQ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX29Q8TEQ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX29Q8TEQ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms