Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RASGRP4Q8TDF6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RASGRP4Q8TDF6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RASGRP4Q8TDF6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RASGRP4Q8TDF6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RASGRP4Q8TDF6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RASGRP4Q8TDF6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RASGRP4Q8TDF6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RASGRP4Q8TDF6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RASGRP4Q8TDF6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASGRP4Q8TDF6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RASGRP4Q8TDF6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASGRP4Q8TDF6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASGRP4Q8TDF6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASGRP4Q8TDF6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASGRP4Q8TDF6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASGRP4Q8TDF6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms