Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRFBP1Q8NEF9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRFBP1Q8NEF9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SRFBP1Q8NEF9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRFBP1Q8NEF9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRFBP1Q8NEF9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms