Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AVL9Q8NBF6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AVL9Q8NBF6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AVL9Q8NBF6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AVL9Q8NBF6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms