Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HACE1Q8IYU2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACE1Q8IYU2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HACE1Q8IYU2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HACE1Q8IYU2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms