Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX8Q6ZV50 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX8Q6ZV50 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX8Q6ZV50 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RFX8Q6ZV50 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX8Q6ZV50 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX8Q6ZV50 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX8Q6ZV50 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX8Q6ZV50 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX8Q6ZV50 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX8Q6ZV50 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX8Q6ZV50 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX8Q6ZV50 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFX8Q6ZV50 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RFX8Q6ZV50 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RFX8Q6ZV50 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFX8Q6ZV50 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFX8Q6ZV50 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms