Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RANBP10Q6VN20 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RANBP10Q6VN20 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANBP10Q6VN20 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RANBP10Q6VN20 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms