Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SAMD1Q6SPF0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SAMD1Q6SPF0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SAMD1Q6SPF0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SAMD1Q6SPF0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SAMD1Q6SPF0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1104.3 ms