Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP17L2Q6R6M4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
USP17L2Q6R6M4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP17L2Q6R6M4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP17L2Q6R6M4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L2Q6R6M4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms