Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3F3CQ6NXT2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3F3CQ6NXT2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H3F3CQ6NXT2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3F3CQ6NXT2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3F3CQ6NXT2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms