Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRAMD4Q6IC98 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRAMD4Q6IC98 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRAMD4Q6IC98 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRAMD4Q6IC98 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRAMD4Q6IC98 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms