Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MCTP1Q6DN14 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MCTP1Q6DN14 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MCTP1Q6DN14 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MCTP1Q6DN14 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCTP1Q6DN14 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCTP1Q6DN14 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms