Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TIGD3Q6B0B8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIGD3Q6B0B8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIGD3Q6B0B8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms