Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FNDC7Q5VTL7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC7Q5VTL7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC7Q5VTL7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FNDC7Q5VTL7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FNDC7Q5VTL7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC7Q5VTL7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC7Q5VTL7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC7Q5VTL7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FNDC7Q5VTL7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FNDC7Q5VTL7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FNDC7Q5VTL7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FNDC7Q5VTL7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms