Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGEF3Q5TH69 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGEF3Q5TH69 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARFGEF3Q5TH69 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGEF3Q5TH69 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARFGEF3Q5TH69 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ARFGEF3Q5TH69 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ARFGEF3Q5TH69 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms