Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
XKR3Q5GH77 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
XKR3Q5GH77 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
XKR3Q5GH77 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XKR3Q5GH77 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
XKR3Q5GH77 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
XKR3Q5GH77 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
XKR3Q5GH77 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms