Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMG9

TMEM52B, Transmembrane protein 52B, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM52BQ4KMG9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM52BQ4KMG9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM52BQ4KMG9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM52BQ4KMG9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM52BQ4KMG9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM52BQ4KMG9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM52BQ4KMG9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM52BQ4KMG9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM52BQ4KMG9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM52BQ4KMG9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM52BQ4KMG9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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