Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KNOP1Q1ED39 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNOP1Q1ED39 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNOP1Q1ED39 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KNOP1Q1ED39 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNOP1Q1ED39 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms