Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NFIL3Q16649 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NFIL3Q16649 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFIL3Q16649 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFIL3Q16649 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NFIL3Q16649 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFIL3Q16649 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIL3Q16649 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIL3Q16649 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIL3Q16649 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIL3Q16649 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NFIL3Q16649 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIL3Q16649 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFIL3Q16649 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NFIL3Q16649 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NFIL3Q16649 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFIL3Q16649 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIL3Q16649 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIL3Q16649 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIL3Q16649 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms