Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC6Q16204 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC6Q16204 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC6Q16204 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC6Q16204 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
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