Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNB3Q15768 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNB3Q15768 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNB3Q15768 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFNB3Q15768 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNB3Q15768 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms