Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYTH1Q15438 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYTH1Q15438 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYTH1Q15438 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYTH1Q15438 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYTH1Q15438 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms