Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT31Q15323 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT31Q15323 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT31Q15323 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT31Q15323 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT31Q15323 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT31Q15323 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT31Q15323 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT31Q15323 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT31Q15323 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT31Q15323 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
KRT31Q15323 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT31Q15323 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT31Q15323 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT31Q15323 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT31Q15323 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT31Q15323 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT31Q15323 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT31Q15323 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT31Q15323 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT31Q15323 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT31Q15323 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT31Q15323 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT31Q15323 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KRT31Q15323 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT31Q15323 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT31Q15323 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT31Q15323 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT31Q15323 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT31Q15323 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT31Q15323 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT31Q15323 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT31Q15323 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT31Q15323 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT31Q15323 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT31Q15323 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT31Q15323 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
KRT31Q15323 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KRT31Q15323 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT31Q15323 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT31Q15323 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT31Q15323 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms