Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CREMQ03060 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CREMQ03060 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREMQ03060 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREMQ03060 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CREMQ03060 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREMQ03060 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CREMQ03060 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CREMQ03060 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CREMQ03060 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CREMQ03060 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CREMQ03060 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CREMQ03060 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREMQ03060 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREMQ03060 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREMQ03060 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREMQ03060 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CREMQ03060 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREMQ03060 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREMQ03060 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREMQ03060 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREMQ03060 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREMQ03060 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREMQ03060 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREMQ03060 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CREMQ03060 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CREMQ03060 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CREMQ03060 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CREMQ03060 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CREMQ03060 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CREMQ03060 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CREMQ03060 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CREMQ03060 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CREMQ03060 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CREMQ03060 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREMQ03060 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREMQ03060 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREMQ03060 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREMQ03060 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREMQ03060 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREMQ03060 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREMQ03060 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREMQ03060 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREMQ03060 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREMQ03060 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CREMQ03060 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREMQ03060 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CREMQ03060 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CREMQ03060 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CREMQ03060 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CREMQ03060 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CREMQ03060 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CREMQ03060 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREMQ03060 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREMQ03060 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREMQ03060 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CREMQ03060 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CREMQ03060 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CREMQ03060 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CREMQ03060 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREMQ03060 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREMQ03060 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREMQ03060 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREMQ03060 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CREMQ03060 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CREMQ03060 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CREMQ03060 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CREMQ03060 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CREMQ03060 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CREMQ03060 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREMQ03060 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREMQ03060 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREMQ03060 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREMQ03060 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CREMQ03060 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREMQ03060 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CREMQ03060 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREMQ03060 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREMQ03060 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREMQ03060 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREMQ03060 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CREMQ03060 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREMQ03060 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREMQ03060 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREMQ03060 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CREMQ03060 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREMQ03060 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREMQ03060 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREMQ03060 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CREMQ03060 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CREMQ03060 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREMQ03060 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREMQ03060 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREMQ03060 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREMQ03060 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREMQ03060 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CREMQ03060 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREMQ03060 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREMQ03060 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CREMQ03060 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms