Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ROR1Q01973 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ROR1Q01973 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ROR1Q01973 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ROR1Q01973 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ROR1Q01973 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ROR1Q01973 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms