Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC5P78333 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC5P78333 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC5P78333 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPC5P78333 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPC5P78333 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GPC5P78333 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPC5P78333 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPC5P78333 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPC5P78333 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GPC5P78333 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPC5P78333 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GPC5P78333 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPC5P78333 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPC5P78333 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPC5P78333 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPC5P78333 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPC5P78333 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPC5P78333 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPC5P78333 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPC5P78333 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPC5P78333 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPC5P78333 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPC5P78333 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPC5P78333 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPC5P78333 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GPC5P78333 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPC5P78333 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPC5P78333 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPC5P78333 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPC5P78333 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPC5P78333 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPC5P78333 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPC5P78333 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPC5P78333 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPC5P78333 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GPC5P78333 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC5P78333 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC5P78333 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC5P78333 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC5P78333 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC5P78333 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPC5P78333 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GPC5P78333 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC5P78333 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC5P78333 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC5P78333 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC5P78333 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPC5P78333 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC5P78333 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC5P78333 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC5P78333 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC5P78333 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPC5P78333 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC5P78333 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC5P78333 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC5P78333 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC5P78333 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC5P78333 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC5P78333 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPC5P78333 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC5P78333 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC5P78333 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC5P78333 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC5P78333 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC5P78333 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GPC5P78333 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPC5P78333 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPC5P78333 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GPC5P78333 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC5P78333 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC5P78333 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC5P78333 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC5P78333 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC5P78333 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC5P78333 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC5P78333 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC5P78333 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GPC5P78333 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC5P78333 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC5P78333 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC5P78333 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GPC5P78333 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GPC5P78333 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GPC5P78333 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GPC5P78333 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPC5P78333 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GPC5P78333 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GPC5P78333 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GPC5P78333 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GPC5P78333 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC5P78333 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC5P78333 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC5P78333 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC5P78333 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC5P78333 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GPC5P78333 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC5P78333 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC5P78333 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GPC5P78333 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms