Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVK-24P63145 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVK-24P63145 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERVK-24P63145 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERVK-24P63145 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms