Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP54P61011 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP54P61011 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRP54P61011 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP54P61011 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP54P61011 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP54P61011 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP54P61011 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP54P61011 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP54P61011 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP54P61011 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP54P61011 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP54P61011 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP54P61011 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP54P61011 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP54P61011 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP54P61011 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP54P61011 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRP54P61011 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SRP54P61011 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRP54P61011 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRP54P61011 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRP54P61011 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRP54P61011 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRP54P61011 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRP54P61011 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRP54P61011 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRP54P61011 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRP54P61011 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRP54P61011 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRP54P61011 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRP54P61011 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRP54P61011 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRP54P61011 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRP54P61011 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRP54P61011 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP54P61011 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP54P61011 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP54P61011 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP54P61011 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRP54P61011 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP54P61011 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP54P61011 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP54P61011 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRP54P61011 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP54P61011 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP54P61011 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP54P61011 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP54P61011 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP54P61011 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP54P61011 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRP54P61011 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRP54P61011 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP54P61011 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP54P61011 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRP54P61011 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP54P61011 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP54P61011 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP54P61011 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP54P61011 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRP54P61011 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP54P61011 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP54P61011 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRP54P61011 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP54P61011 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP54P61011 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP54P61011 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP54P61011 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP54P61011 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRP54P61011 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP54P61011 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP54P61011 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP54P61011 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRP54P61011 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRP54P61011 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP54P61011 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP54P61011 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRP54P61011 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP54P61011 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP54P61011 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP54P61011 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP54P61011 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRP54P61011 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP54P61011 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP54P61011 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP54P61011 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP54P61011 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP54P61011 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRP54P61011 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP54P61011 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRP54P61011 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP54P61011 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP54P61011 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP54P61011 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP54P61011 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP54P61011 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP54P61011 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP54P61011 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRP54P61011 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRP54P61011 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms