Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF135P52742 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF135P52742 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF135P52742 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF135P52742 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF135P52742 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms