Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF6P49848 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF6P49848 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF6P49848 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF6P49848 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF6P49848 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF6P49848 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF6P49848 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF6P49848 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF6P49848 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF6P49848 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF6P49848 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF6P49848 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF6P49848 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TAF6P49848 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF6P49848 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF6P49848 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF6P49848 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF6P49848 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF6P49848 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF6P49848 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF6P49848 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF6P49848 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF6P49848 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF6P49848 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF6P49848 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF6P49848 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF6P49848 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF6P49848 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF6P49848 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF6P49848 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF6P49848 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF6P49848 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF6P49848 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TAF6P49848 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF6P49848 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF6P49848 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF6P49848 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF6P49848 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF6P49848 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF6P49848 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF6P49848 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF6P49848 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF6P49848 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF6P49848 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF6P49848 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF6P49848 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF6P49848 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF6P49848 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF6P49848 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF6P49848 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF6P49848 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF6P49848 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF6P49848 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF6P49848 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF6P49848 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF6P49848 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF6P49848 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF6P49848 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF6P49848 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF6P49848 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF6P49848 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF6P49848 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF6P49848 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF6P49848 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF6P49848 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF6P49848 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF6P49848 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF6P49848 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF6P49848 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF6P49848 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF6P49848 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF6P49848 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF6P49848 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF6P49848 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF6P49848 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF6P49848 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF6P49848 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF6P49848 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF6P49848 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF6P49848 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF6P49848 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF6P49848 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF6P49848 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF6P49848 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF6P49848 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF6P49848 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF6P49848 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF6P49848 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF6P49848 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF6P49848 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF6P49848 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF6P49848 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF6P49848 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF6P49848 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF6P49848 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF6P49848 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF6P49848 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF6P49848 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF6P49848 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms