Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASRP41180 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASRP41180 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASRP41180 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASRP41180 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASRP41180 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASRP41180 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASRP41180 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASRP41180 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CASRP41180 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASRP41180 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASRP41180 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASRP41180 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CASRP41180 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASRP41180 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASRP41180 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CASRP41180 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASRP41180 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASRP41180 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASRP41180 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASRP41180 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASRP41180 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASRP41180 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASRP41180 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASRP41180 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CASRP41180 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASRP41180 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASRP41180 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASRP41180 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASRP41180 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASRP41180 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASRP41180 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASRP41180 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASRP41180 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASRP41180 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASRP41180 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CASRP41180 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASRP41180 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASRP41180 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASRP41180 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASRP41180 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASRP41180 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASRP41180 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASRP41180 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASRP41180 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASRP41180 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASRP41180 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASRP41180 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASRP41180 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASRP41180 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASRP41180 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASRP41180 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASRP41180 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASRP41180 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASRP41180 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASRP41180 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASRP41180 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASRP41180 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASRP41180 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASRP41180 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASRP41180 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASRP41180 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms