Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH1P40692 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH1P40692 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH1P40692 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH1P40692 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH1P40692 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH1P40692 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH1P40692 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH1P40692 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH1P40692 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH1P40692 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH1P40692 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH1P40692 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH1P40692 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH1P40692 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH1P40692 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH1P40692 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH1P40692 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH1P40692 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH1P40692 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH1P40692 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH1P40692 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH1P40692 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH1P40692 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH1P40692 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH1P40692 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MLH1P40692 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH1P40692 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MLH1P40692 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH1P40692 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH1P40692 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH1P40692 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH1P40692 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MLH1P40692 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH1P40692 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH1P40692 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MLH1P40692 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH1P40692 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH1P40692 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MLH1P40692 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH1P40692 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH1P40692 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MLH1P40692 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MLH1P40692 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MLH1P40692 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH1P40692 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH1P40692 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH1P40692 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MLH1P40692 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH1P40692 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH1P40692 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH1P40692 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MLH1P40692 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH1P40692 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH1P40692 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH1P40692 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH1P40692 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH1P40692 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MLH1P40692 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH1P40692 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH1P40692 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH1P40692 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MLH1P40692 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MLH1P40692 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MLH1P40692 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MLH1P40692 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MLH1P40692 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MLH1P40692 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH1P40692 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH1P40692 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH1P40692 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH1P40692 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH1P40692 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MLH1P40692 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH1P40692 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH1P40692 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH1P40692 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH1P40692 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH1P40692 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH1P40692 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH1P40692 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MLH1P40692 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH1P40692 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MLH1P40692 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH1P40692 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH1P40692 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH1P40692 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH1P40692 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH1P40692 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MLH1P40692 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH1P40692 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH1P40692 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH1P40692 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MLH1P40692 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH1P40692 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MLH1P40692 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH1P40692 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH1P40692 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH1P40692 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MLH1P40692 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms