Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL3P10147 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL3P10147 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL3P10147 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL3P10147 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL3P10147 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL3P10147 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL3P10147 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL3P10147 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL3P10147 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL3P10147 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL3P10147 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL3P10147 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL3P10147 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL3P10147 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL3P10147 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL3P10147 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCL3P10147 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL3P10147 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL3P10147 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL3P10147 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL3P10147 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL3P10147 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL3P10147 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL3P10147 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL3P10147 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL3P10147 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL3P10147 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL3P10147 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL3P10147 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL3P10147 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL3P10147 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL3P10147 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL3P10147 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL3P10147 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL3P10147 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL3P10147 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL3P10147 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL3P10147 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL3P10147 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL3P10147 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL3P10147 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL3P10147 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL3P10147 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL3P10147 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL3P10147 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL3P10147 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL3P10147 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL3P10147 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL3P10147 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL3P10147 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL3P10147 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL3P10147 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL3P10147 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL3P10147 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL3P10147 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL3P10147 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL3P10147 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL3P10147 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL3P10147 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL3P10147 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL3P10147 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL3P10147 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL3P10147 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL3P10147 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL3P10147 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL3P10147 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL3P10147 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL3P10147 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL3P10147 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL3P10147 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL3P10147 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL3P10147 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL3P10147 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL3P10147 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL3P10147 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL3P10147 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL3P10147 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL3P10147 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL3P10147 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL3P10147 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL3P10147 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL3P10147 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL3P10147 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL3P10147 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL3P10147 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL3P10147 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL3P10147 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL3P10147 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL3P10147 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL3P10147 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL3P10147 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL3P10147 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL3P10147 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL3P10147 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL3P10147 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL3P10147 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL3P10147 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL3P10147 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL3P10147 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms