Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP2BP0DMP2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP2BP0DMP2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRGAP2BP0DMP2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms